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| 20.03.2009 | 19:00 | VFC Plauen | - | VfB Lübeck | 3:3 (1:1) | |
| 19:00 | Hannover 96 II | - | Chemnitzer FC | 1:1 (0:0) | ||
| 21.03.2009 | 13:30 | Hallescher FC | - | Altona 93 | 2:0 (0:0) | |
| 14:00 | Hamburger SV II | - | Energie Cottbus II | 0:1 (0:0) | ||
| 14:00 | VfL Wolfsburg II | - | SV Wilhelmshaven | 5:2 (2:2) | ||
| 14:00 | Holstein Kiel | - | FC Oberneuland | 1:1 (1:1) | ||
| 14:00 | SV Babelsberg 03 | - | Türkiyemspor Berlin | 1:0 (1:0) | ||
| 22.03.2009 | 13:30 | Hertha BSC II | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 (1:0) | |
| 13:30 | Hansa Rostock II | - | Sachsen Leipzig | 3:2 (1:2) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Holstein Kiel | 23 | 15 | 6 | 2 | 39:17 | 22 | 51 |
| 2 |
|
Hallescher FC | 23 | 13 | 10 | 0 | 26:8 | 18 | 49 |
| 3 |
|
SV Babelsberg 03 | 23 | 12 | 10 | 1 | 29:11 | 18 | 46 |
| 4 |
|
1. FC Magdeburg | 23 | 13 | 5 | 5 | 33:18 | 15 | 44 |
| 5 |
|
Hannover 96 II | 23 | 10 | 4 | 9 | 33:27 | 6 | 34 |
| 6 |
|
VfL Wolfsburg II | 23 | 9 | 6 | 8 | 36:24 | 12 | 33 |
| 7 |
|
Hansa Rostock II | 23 | 10 | 3 | 10 | 38:37 | 1 | 33 |
| 8 |
|
Chemnitzer FC | 23 | 8 | 8 | 7 | 34:25 | 9 | 32 |
| 9 |
|
SV Wilhelmshaven | 23 | 8 | 6 | 9 | 29:34 | -5 | 30 |
| 10 |
|
Hertha BSC II | 23 | 8 | 6 | 9 | 23:33 | -10 | 30 |
| 11 |
|
FC Oberneuland | 23 | 7 | 7 | 9 | 23:24 | -1 | 28 |
| 12 |
|
VFC Plauen | 23 | 7 | 7 | 9 | 32:36 | -4 | 28 |
| 13 |
|
VfB Lübeck | 23 | 5 | 12 | 6 | 24:24 | 0 | 27 |
| 14 |
|
Türkiyemspor Berlin | 23 | 7 | 3 | 13 | 21:33 | -12 | 24 |
| 15 |
|
Hamburger SV II | 23 | 6 | 5 | 12 | 26:29 | -3 | 23 |
| 16 |
|
Altona 93 | 23 | 6 | 5 | 12 | 26:42 | -16 | 23 |
| 17 |
|
Sachsen Leipzig | 23 | 3 | 7 | 13 | 12:37 | -25 | 16 |
| 18 |
|
Energie Cottbus II | 23 | 2 | 6 | 15 | 14:39 | -25 | 12 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
