# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 24 17 7 0 60:10 50 58
2 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 24 15 4 5 55:24 31 49
3 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 24 12 8 4 42:25 17 44
4 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 24 11 6 7 56:35 21 39
5 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 24 10 8 6 35:23 12 38
6 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 24 10 6 8 38:34 4 36
7 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 24 11 3 10 48:48 0 36
8 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 24 10 5 9 52:38 14 35
9 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 24 10 5 9 39:39 0 35
10 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 24 9 5 10 40:36 4 32
11 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 24 8 7 9 33:32 1 31
12 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 24 7 6 11 38:56 -18 27
13 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 24 8 2 14 34:57 -23 26
14 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 24 6 7 11 36:49 -13 25
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 24 3 5 16 25:58 -33 14
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 24 2 2 20 14:81 -67 8
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz