# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 17 13 4 0 47:9 38 43
2 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 17 11 3 3 41:17 24 36
3 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 17 9 5 3 31:19 12 32
4 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 17 10 1 6 40:32 8 31
5 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 17 9 3 5 29:23 6 30
6 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 17 9 2 6 42:26 16 29
7 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 17 8 3 6 41:23 18 27
8 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 17 7 5 5 25:18 7 26
9 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 17 7 4 6 32:28 4 25
10 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 17 6 3 8 24:29 -5 21
11 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 17 5 4 8 23:41 -18 19
12 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 17 4 5 8 19:26 -7 17
13 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 17 5 1 11 24:45 -21 16
14 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 17 3 6 8 19:30 -11 15
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 17 2 3 12 17:44 -27 9
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 17 1 2 14 12:56 -44 5
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz