# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 34 27 5 2 98:28 70 86
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 34 25 7 2 106:20 86 82
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 34 22 6 6 90:30 60 72
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 34 19 4 11 98:45 53 61
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 34 13 5 16 45:55 -10 44
6 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 34 10 6 18 51:72 -21 36
7 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 34 9 9 16 39:60 -21 36
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 34 8 8 18 41:85 -44 32
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 34 7 4 23 32:92 -60 25
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 34 2 2 30 26:139 -113 8
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.