# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 28 23 4 1 82:20 62 73
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 28 19 7 2 81:17 64 64
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 28 19 4 5 73:24 49 61
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 28 17 3 8 84:34 50 54
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 28 9 5 14 35:44 -9 32
6 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 28 7 8 13 32:48 -16 29
7 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 28 8 5 15 41:61 -20 29
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 28 6 7 15 32:69 -37 25
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 28 7 1 20 26:77 -51 22
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 28 2 2 24 22:114 -92 8
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.