# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 19 15 4 0 55:10 45 49
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 19 13 6 0 51:12 39 45
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 19 13 3 3 52:16 36 42
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 19 10 3 6 52:22 30 33
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 19 7 4 8 27:29 -2 25
6 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 19 5 4 10 22:38 -16 19
7 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 19 4 6 9 19:34 -15 18
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 19 4 5 10 22:44 -22 17
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 19 3 1 15 11:52 -41 10
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 19 2 2 15 16:70 -54 8
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.