# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 19 14 1 4 47:24 23 43
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 19 14 1 4 31:18 13 43
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 19 11 3 5 37:13 24 36
4 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 19 10 4 5 27:16 11 34
5 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 19 9 5 5 32:24 8 32
6 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 19 9 4 6 29:25 4 31
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 19 10 1 8 32:31 1 31
8 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 19 8 6 5 20:17 3 30
9 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 19 7 7 5 25:25 0 28
10 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 19 7 6 6 25:23 2 27
11 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 19 7 4 8 27:31 -4 25
12 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 19 5 6 8 27:29 -2 21
13 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 19 5 6 8 19:25 -6 21
14 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 19 5 6 8 21:29 -8 21
15 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 19 5 4 10 21:27 -6 19
16 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 19 4 6 9 18:28 -10 18
17 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 19 4 6 9 17:30 -13 18
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 19 3 8 8 18:31 -13 17
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 19 4 4 11 24:34 -10 16
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 19 2 6 11 10:27 -17 12
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.