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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 37 | 19 | 13 | 5 | 37:12 | 25 | 70 |
| 2 |
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1. FC Magdeburg | 37 | 15 | 16 | 6 | 40:17 | 23 | 61 |
| 3 |
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Hansa Rostock | 37 | 15 | 15 | 7 | 22:11 | 11 | 60 |
| 4 |
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Karlsruher SC | 37 | 14 | 18 | 5 | 20:11 | 9 | 60 |
| 5 |
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SV Meppen | 37 | 16 | 11 | 10 | 23:16 | 7 | 59 |
| 6 |
|
SV Wehen Wiesbaden | 37 | 14 | 15 | 8 | 31:15 | 16 | 57 |
| 7 |
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Preußen Münster | 37 | 13 | 11 | 13 | 23:24 | -1 | 50 |
| 8 |
|
Würzburger Kickers | 37 | 12 | 13 | 12 | 16:19 | -3 | 49 |
| 9 |
|
Fortuna Köln | 37 | 10 | 17 | 10 | 24:23 | 1 | 47 |
| 10 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 37 | 9 | 20 | 8 | 19:24 | -5 | 47 |
| 11 |
|
VfR Aalen | 37 | 10 | 16 | 11 | 21:21 | 0 | 46 |
| 12 |
|
Werder Bremen II | 37 | 9 | 18 | 10 | 18:24 | -6 | 45 |
| 13 |
|
SpVgg Unterhaching | 37 | 10 | 14 | 13 | 23:24 | -1 | 44 |
| 14 |
|
FSV Zwickau | 37 | 10 | 14 | 13 | 20:25 | -5 | 44 |
| 15 |
|
VfL Osnabrück | 37 | 10 | 12 | 15 | 21:29 | -8 | 42 |
| 16 |
|
Chemnitzer FC | 37 | 9 | 15 | 13 | 22:31 | -9 | 42 |
| 17 |
|
Hallescher FC | 37 | 9 | 14 | 14 | 21:25 | -4 | 41 |
| 18 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 37 | 9 | 14 | 14 | 23:32 | -9 | 41 |
| 19 |
|
Sportfreunde Lotte | 37 | 6 | 15 | 16 | 19:31 | -12 | 33 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 37 | 2 | 17 | 18 | 9:38 | -29 | 23 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
