# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 18 13 1 4 44:23 21 40
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 18 13 1 4 29:18 11 40
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 18 11 3 4 37:12 25 36
4 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 18 9 5 4 31:21 10 32
5 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 18 9 4 5 24:15 9 31
6 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 18 10 1 7 32:29 3 31
7 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 18 8 5 5 20:17 3 29
8 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 18 8 4 6 25:24 1 28
9 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 18 7 6 5 23:23 0 27
10 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 18 6 6 6 24:23 1 24
11 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 18 6 4 8 23:30 -7 22
12 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 18 5 5 8 26:28 -2 20
13 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 18 5 5 8 19:25 -6 20
14 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 18 5 4 9 21:25 -4 19
15 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 18 4 6 8 17:24 -7 18
16 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 18 4 6 8 19:29 -10 18
17 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 18 4 5 9 16:29 -13 17
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 18 3 7 8 16:29 -13 16
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 18 4 4 10 23:31 -8 7
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 18 2 6 10 9:23 -14 2
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.