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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MSV Duisburg | 24 | 11 | 12 | 1 | 18:5 | 13 | 45 |
| 2 |
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SpVgg Greuther Fürth | 24 | 11 | 9 | 4 | 19:12 | 7 | 42 |
| 3 |
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Alemannia Aachen | 24 | 10 | 8 | 6 | 21:12 | 9 | 38 |
| 4 |
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Eintracht Frankfurt | 24 | 10 | 7 | 7 | 20:15 | 5 | 37 |
| 5 |
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TSV 1860 München | 24 | 8 | 10 | 6 | 16:13 | 3 | 34 |
| 6 |
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Karlsruher SC | 24 | 9 | 7 | 8 | 18:19 | -1 | 34 |
| 7 |
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Erzgebirge Aue | 24 | 7 | 11 | 6 | 14:10 | 4 | 32 |
| 8 |
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LR Ahlen | 24 | 7 | 10 | 7 | 13:14 | -1 | 31 |
| 9 |
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1. FC Saarbrücken | 24 | 9 | 4 | 11 | 16:20 | -4 | 31 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 24 | 8 | 6 | 10 | 17:16 | 1 | 30 |
| 11 |
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Energie Cottbus | 24 | 5 | 13 | 6 | 11:13 | -2 | 28 |
| 12 |
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Wacker Burghausen | 24 | 7 | 7 | 10 | 10:16 | -6 | 28 |
| 13 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 24 | 7 | 7 | 10 | 13:20 | -7 | 28 |
| 14 |
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Eintracht Trier | 24 | 5 | 12 | 7 | 15:17 | -2 | 27 |
| 15 |
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1. FC Köln | 24 | 5 | 11 | 8 | 16:13 | 3 | 26 |
| 16 |
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Dynamo Dresden | 24 | 6 | 8 | 10 | 13:16 | -3 | 26 |
| 17 |
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Rot-Weiss Essen | 24 | 5 | 11 | 8 | 10:18 | -8 | 26 |
| 18 |
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Rot-Weiß Erfurt | 24 | 4 | 11 | 9 | 8:19 | -11 | 23 |
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# Das Spiel LR Ahlen - Wacker Burghausen (1:0, 9. Spieltag) wurde wegen des Wettskandals annulliert. Das Wiederholungsspiel gewannen die Gäste mit 3:1. # Das Spiel Rot-Weiß Erfurt - SpVgg Unterhaching (24. Spieltag, 2:0) wurde mit 0:2 gewertet. Der Erfurter Senad Tiganj wurde des Dopings überführt. |
