| 3. Spieltag | 10.08.2013 | Wacker Burghausen | - | RB Leipzig | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 08.09.2013 | VfB Stuttgart II | - | Wacker Burghausen | 4:0 | ||||
| 9. Spieltag | 14.09.2013 | Wacker Burghausen | - | VfL Osnabrück | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 22.09.2013 | SpVgg Unterhaching | - | Wacker Burghausen | 1:3 |  |
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| 11. Spieltag | 28.09.2013 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 2:2 | ||||
| 17. Spieltag | 23.11.2013 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Saarbrücken | 1:2 |  |
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| 18. Spieltag | 30.11.2013 | Stuttgarter Kickers | - | Wacker Burghausen | 3:1 | ||||
| 27. Spieltag | 01.03.2014 | Wacker Burghausen | - | VfB Stuttgart II | 2:2 | ||||
| 28. Spieltag | 08.03.2014 | VfL Osnabrück | - | Wacker Burghausen | 2:1 |
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