| 19. Spieltag | 27.01.2017 | FK Vllaznia | - | FK Kukësi | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 05.02.2017 | FK Kukësi | - | KF Teuta Durrës | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 11.02.2017 | KF Tiranë | - | FK Kukësi | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 20.02.2017 | KF Laçi | - | FK Kukësi | 0:0 |  |
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| 23. Spieltag | 26.02.2017 | FK Kukësi | - | FK Partizani | 0:0 | |
|||
| 24. Spieltag | 05.03.2017 | Flamurtari Vlorë | - | FK Kukësi | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2017 | FK Kukësi | - | KS Korabi Peshkopi | 4:0 | ||||
| 26. Spieltag | 17.03.2017 | KF Skënderbeu | - | FK Kukësi | 1:1 | ||||
| 34. Spieltag | 15.05.2017 | KS Korabi Peshkopi | - | FK Kukësi | 1:3 | ||||
| 36. Spieltag | 27.05.2017 | Luftëtari Gjirokastër | - | FK Kukësi | 1:0 |
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