| 12. Spieltag | 06.11.2016 | SV Sandhausen | - | TSV 1860 München | 3:2 | ||||
| 13. Spieltag | 21.11.2016 | TSV 1860 München | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 27.01.2017 | TSV 1860 München | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 03.02.2017 | Arminia Bielefeld | - | TSV 1860 München | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 11.02.2017 | TSV 1860 München | - | Karlsruher SC | 2:1 |  |
|||
| 21. Spieltag | 20.02.2017 | TSV 1860 München | - | 1. FC Nürnberg | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 24.02.2017 | 1. FC Union Berlin | - | TSV 1860 München | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 04.03.2017 | TSV 1860 München | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 24. Spieltag | 11.03.2017 | Hannover 96 | - | TSV 1860 München | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 17.03.2017 | TSV 1860 München | - | Würzburger Kickers | 2:1 | ||||
| 26. Spieltag | 31.03.2017 | Fortuna Düsseldorf | - | TSV 1860 München | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 05.04.2017 | TSV 1860 München | - | VfB Stuttgart | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | Erzgebirge Aue | - | TSV 1860 München | 3:0 |  |
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| 31. Spieltag | 30.04.2017 | TSV 1860 München | - | Eintracht Braunschweig | 0:1 |
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