| 2. Spieltag | 02.08.2008 | Wuppertaler SV | - | Bayern München II | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 16.08.2008 | VfB Stuttgart II | - | Wuppertaler SV | 2:0 | ||||
| 4. Spieltag | 23.08.2008 | Wuppertaler SV | - | Kickers Offenbach | 2:1 |  |
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| 5. Spieltag | 30.08.2008 | 1. FC Union Berlin | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 8. Spieltag | 27.09.2008 | Eintracht Braunschweig | - | Wuppertaler SV | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 03.10.2008 | Wuppertaler SV | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 31.10.2008 | Wuppertaler SV | - | Stuttgarter Kickers | 3:3 | ||||
| 14. Spieltag | 08.11.2008 | Fortuna Düsseldorf | - | Wuppertaler SV | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 15.11.2008 | Wuppertaler SV | - | SpVgg Unterhaching | 2:4 | ||||
| 16. Spieltag | 22.11.2008 | SV Sandhausen | - | Wuppertaler SV | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 29.11.2008 | Wuppertaler SV | - | Jahn Regensburg | 0:0 | |
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| 19. Spieltag | 13.12.2008 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:2 | ||||
| 20. Spieltag | 20.12.2008 | Wuppertaler SV | - | Kickers Emden | 0:3 | ||||
| 27. Spieltag | 22.03.2009 | Wuppertaler SV | - | Eintracht Braunschweig | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 09.05.2009 | Wuppertaler SV | - | SV Sandhausen | 1:0 | ||||
| 36. Spieltag | 12.05.2009 | Jahn Regensburg | - | Wuppertaler SV | 2:0 |
Deutschland