| 2. Spieltag | 08.03.2016 | FC Flora | - | Rakvere JK Tarvas | 6:0 | ||||
| 4. Spieltag | 19.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 22.04.2016 | Pärnu Linnameeskond | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 10. Spieltag | 29.04.2016 | FC Flora | - | Pärnu Linnameeskond | 6:0 | ||||
| 12. Spieltag | 13.05.2016 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Flora | 2:4 | ||||
| 13. Spieltag | 16.05.2016 | FC Flora | - | JK Tammeka | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 24.05.2016 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:2 |
Estland