1. Spieltag 07.08.2016 SC Freiburg II - SV Spielberg 2:1
2. Spieltag 13.08.2016 SV Oberachern - SC Freiburg II 0:3
3. Spieltag 17.08.2016 SC Freiburg II - FSV 08 Bissingen 0:4
4. Spieltag 21.08.2016 Bahlinger SC - SC Freiburg II 0:0
5. Spieltag 27.08.2016 SC Freiburg II - Stuttgarter Kickers II 2:0
6. Spieltag 31.08.2016 FV Ravensburg - SC Freiburg II 2:1
7. Spieltag 04.09.2016 SC Freiburg II - SpVgg Neckarelz 6:0
8. Spieltag 10.09.2016 SV Sandhausen II - SC Freiburg II 0:2
9. Spieltag 18.09.2016 SC Freiburg II - FC-Astoria Walldorf II 2:0
10. Spieltag 24.09.2016 Offenburger FV - SC Freiburg II 0:4
11. Spieltag 01.10.2016 SC Freiburg II - Göppinger SV 2:0
12. Spieltag 09.10.2016 Karlsruher SC II - SC Freiburg II 0:3
13. Spieltag 15.10.2016 FSV Hollenbach - SC Freiburg II 0:3
14. Spieltag 23.10.2016 SC Freiburg II - SSV Reutlingen 2:0
15. Spieltag 29.10.2016 Neckarsulmer Sport-Union - SC Freiburg II 1:0
16. Spieltag 05.11.2016 SC Freiburg II - 1. CfR Pforzheim 1:0
17. Spieltag 11.11.2016 TSG Balingen - SC Freiburg II 2:0
18. Spieltag 19.11.2016 SV Spielberg - SC Freiburg II 1:1
19. Spieltag 27.11.2016 SC Freiburg II - SV Oberachern 5:0
20. Spieltag 03.12.2016 FSV 08 Bissingen - SC Freiburg II 3:0
21. Spieltag 19.02.2017 SC Freiburg II - Bahlinger SC 0:0
22. Spieltag 26.02.2017 Stuttgarter Kickers II - SC Freiburg II 0:3
23. Spieltag 05.03.2017 SC Freiburg II - FV Ravensburg 4:2
24. Spieltag 11.03.2017 SpVgg Neckarelz - SC Freiburg II 0:2
25. Spieltag 18.03.2017 SC Freiburg II - SV Sandhausen II 6:0
26. Spieltag 26.03.2017 FC-Astoria Walldorf II - SC Freiburg II 0:2
27. Spieltag 02.04.2017 SC Freiburg II - Offenburger FV 3:1
28. Spieltag 08.04.2017 Göppinger SV - SC Freiburg II 1:1
29. Spieltag 15.04.2017 SC Freiburg II - Karlsruher SC II 2:1
30. Spieltag 23.04.2017 SC Freiburg II - FSV Hollenbach 4:1
31. Spieltag 29.04.2017 SSV Reutlingen - SC Freiburg II 0:3
32. Spieltag 07.05.2017 SC Freiburg II - Neckarsulmer Sport-Union 4:0
33. Spieltag 13.05.2017 1. CfR Pforzheim - SC Freiburg II 0:2
34. Spieltag 20.05.2017 SC Freiburg II - TSG Balingen 3:0