| 21. Spieltag | 05.02.2017 | Werder Bremen II | - | Fortuna Köln | 1:1 |  |
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| 23. Spieltag | 18.02.2017 | Werder Bremen II | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 24.02.2017 | VfL Osnabrück | - | Werder Bremen II | 0:1 | |
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| 25. Spieltag | 05.03.2017 | Werder Bremen II | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 11.03.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Werder Bremen II | 0:1 | |
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| 28. Spieltag | 17.03.2017 | Werder Bremen II | - | Preußen Münster | 0:1 | |
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| 30. Spieltag | 01.04.2017 | Werder Bremen II | - | Holstein Kiel | 0:2 | ||||
| 35. Spieltag | 29.04.2017 | SG Sonnenhof Großaspach | - | Werder Bremen II | 0:0 | ||||
| 36. Spieltag | 05.05.2017 | Werder Bremen II | - | Hallescher FC | 1:1 |  |
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| 37. Spieltag | 13.05.2017 | FSV Frankfurt | - | Werder Bremen II | 0:4 | |
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