| Gruppe I | 15.09.2016 | RB Salzburg | - | FK Krasnodar | 0:1 | ||||
| Gruppe I | 29.09.2016 | FK Krasnodar | - | OGC Nice | 5:2 |  |
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| Gruppe I | 20.10.2016 | FK Krasnodar | - | FC Schalke 04 | 0:1 | ||||
| Gruppe I | 03.11.2016 | FC Schalke 04 | - | FK Krasnodar | 2:0 | ||||
| Gruppe I | 24.11.2016 | FK Krasnodar | - | RB Salzburg | 1:1 | ||||
| Gruppe I | 08.12.2016 | OGC Nice | - | FK Krasnodar | 2:1 | |
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| Sechzehntelfinale | 22.02.2017 | Fenerbahçe | - | FK Krasnodar | 1:1 | ||||
| Achtelfinale | 09.03.2017 | RC Celta | - | FK Krasnodar | 2:1 | ||||
| Achtelfinale | 16.03.2017 | FK Krasnodar | - | RC Celta | 0:2 | |
Schweden