# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 16 8 5 3 17:11 6 29
2 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 16 7 8 1 11:5 6 29
3 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 16 7 6 3 14:7 7 27
4 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 16 7 5 4 13:10 3 26
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 16 5 7 4 7:5 2 22
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 16 4 5 7 11:15 -4 17
7 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 16 4 5 6 9:9 0 17
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 16 3 6 6 5:10 -5 15
9 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 16 2 9 5 5:11 -6 15
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 16 2 4 10 3:12 -9 10
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.